ÖNORM EN ISO 23418

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Dieses Dokument legt die Mindestanforderungen für die Generierung und Analyse von Daten der Gesamtgenomsequenzierung (WGS) für Bakterien, die aus der Lebensmittelkette gewonnen wurden, fest. Dieser Prozess kann die folgenden Phasen umfassen: a) Umgang mit Bakterienkulturen; b) keimfreie Isolierung der genomischen DNA; c) Vorbereitung der genomischen DNA-Bibliothek, Sequenzierung und Beurteilung der Read-Qualität von Rohdaten und deren Speicherung; d) bioinformatische Analyse zur Bestimmung der genetischen Verwandtschaft, des genetischen Gehalts und zur Vorhersage des Phänotyps sowie Validierung der bioinformatischen Pipeline; e) die Erfassung von Metadaten und die Hinterlegung von Sequenzdaten in Repositorien; f) Validierung des Gesamt-WGS-Workflows (gebrauchstauglich für die beabsichtigte Anwendung). Dieses Dokument ist anwendbar auf Bakterien, die isoliert wurden aus: - Produkten, die für den menschlichen Verzehr vorgesehen sind; - Produkten, die als Futtermittel vorgesehen sind; - Umgebungsproben aus Bereichen, in denen Lebensmittel und Futtermittel gehandhabt und hergestellt werden; - Proben aus dem Bereich der Primärproduktion.